Skip to content

Genomewide Association Studies of Stroke ad 5

2 miesiące ago

430 words

Wykresy lasu pokazujące związki między polimorfizmami pojedynczego nukleotydu a udarami całkowitymi, niedokrwiennymi i aterotrombotycznymi. Powiązania między rs11833579 a udarem ogólnym (panel A), udarem niedokrwiennym (panel C) i udarem z miażdżycą tętnic (panel E) oraz między rs12425791 a udarem całkowitym (panel B), udarem niedokrwiennym (panel D) i udarem z miażdżycą tętnic (panel F ) są oparte na danych bezpośrednio genotypowanych. Indywidualne badania (niebieskie pola) są wykreślane w zależności od indywidualnych rozmiarów efektu (współczynniki ryzyka). Czerwone diamenty wskazują ogólny stosunek ryzyka. Rozmiar niebieskiego pudełka jest odwrotnie proporcjonalny do wariancji. Linie poziome wskazują 95% przedziały ufności. Przerywana linia pionowa w każdym panelu pokazuje wartość bez efektu (współczynnik ryzyka = 1,0). ARIC oznacza badanie ryzyka miażdżycy w społecznościach, badanie CHS dotyczące układu sercowo-naczyniowego, badanie FHS Framingham Heart Study i badanie RS Rotterdam. Testowaliśmy związek pomiędzy dwoma związanymi SNP i podtypem miażdżycowo-miażdżycowym udaru niedokrwiennego i obserwowaliśmy asocjacje, które były silniejsze niż te z dwóch SNP z wszystkimi udarami niedokrwiennymi. Tak więc dla rs11833579 współczynniki ryzyka wynosiły 1,26 (95% CI, 1,16 do 1,37) dla całkowitego udaru, 1,33 (95% CI, 1,21 do 1,47) dla udaru niedokrwiennego i 1,35 (95% CI, 1,21 do 1,50) dla udaru z miażdżycą tętnic. Współczynniki zagrożenia dla rs12425791 wynosiły 1,30 (95% CI, 1,19 do 1,42) dla całkowitego udaru, 1,33 (95% CI, 1,21 do 1,47) dla udaru niedokrwiennego i 1,37 (95% CI, 1,23 do 1,54) dla udaru z miażdżycą tętnic (ryc. 2). ).
Rysunek 3. Rysunek 3. Powiązania w regionie Wyśrodkowane na rs11833579 i zawierające NINJ2. Wszystkie polimorfizmy pojedynczego nukleotydu są nanoszone na wykresie z ich wartościami P (w analizie połączonej) w odniesieniu do ich pozycji w genomie. Pokazano wartości P dla całkowitego udaru i udaru niedokrwiennego. Jasnoniebieska linia przedstawia szacunkowe wartości rekombinacji. Niebieskie strzałki wskazują adnotacje genów.
Oba SNP były w bliskim sąsiedztwie NINJ2, który koduje ninjurin2, i były ze sobą w znacznym stopniu niezrównoważone (r2 = 0,73 na podstawie danych HapMap CEU, National Center for Biotechnology Information [NCBI] build 36) i SNPs w 5 Nieprzekłumaczalny region NINJ2 (ryc. 3 w dodatkowym dodatku). Figura 3 pokazuje wszystkie SNP w regionie 200 kb po obu stronach tych dwóch SNP, wraz z szybkościami rekombinacji i znanymi genami w tym regionie. Dwa inne SNP, które były również blisko końca 5 NINJ2 (rs7298096 i rs7297967) wykazały silne, choć nieistotne, powiązanie zarówno z udarem całkowitym, jak i niedokrwiennym, przy wartościach P mniejszych niż 5 x 10-5 (Tabela 2, i Tabele i 2 w Dodatku Uzupełniającym). Ponadto, kilka innych SNP w obrębie NINJ2 wykazywało niewielkie połączenie (P <0,01) z obydwoma fenotypami (13 SNP wykazywało niewielki związek z udarem całkowitym i 10 SNP z udarem niedokrwiennym).
Drugim najbliższym genem rs12425791 i rs11833579 jest WNK1, chociaż jest on oddzielony od tych SNP przez domniemany rekombinowany gorący punkt. Ten gen koduje kinazę białkową z deficytem lizyny 1. WNK1 był powiązany z poziomem ciśnienia krwi i ciężkości nadciśnienia tętniczego w populacji ogólnej.29,30 Dostosowywanie analiz skurczowego ciśnienia krwi, nadciśnienia, cukrzycy, migotania przedsionków i obecne palenie pojedynczo lub razem miało znikomy wpływ na obserwowane skojarzenia (Tabela 3 w Dodatku Uzupełniającym).
Zaobserwowaliśmy replikację związku pomiędzy RS12425791 a udarem u czarnych uczestników badania AR
[hasła pokrewne: przychodnia bytom, wzór skierowania na badania okresowe, piramida zdrowego żywienia dla dzieci ]

Powiązane tematy z artykułem: piramida zdrowego żywienia dla dzieci przychodnia bytom wzór skierowania na badania okresowe